舰船改造是无尽的拉格朗日中的核心玩法之一，通过合理调整舰船属性、武器系统和战术定位，可以显著提升舰队的整体作战能力。改造的核心在于蓝图强化，玩家需要在蓝图界面选择目标舰船，并投入技术值对武器、护甲、动力等系统进行针对性升级。每项强化都会直接影响舰船的战斗表现，例如提升主炮伤害、增强护盾抗性或优化能源效率。技术值主要通过战斗、任务或开箱获取，因此需要合理规划分配优先级。
突击舰通常需要优先强化火力与突进能力，确保其在前排能快速压制敌方；轰炸舰则应侧重持久输出，因此冷却缩减与暴击率是关键；防御舰的核心改造目标是护甲与能量抗性，以最大化吸收伤害；支援舰则需根据技能效果调整，例如治疗型舰船应优先缩短技能冷却时间。部分舰船拥有特殊子系统，如防空模块或维修无人机，这些也需要针对性强化以发挥战术价值。
同一舰船可能拥有多种子型号，例如载机型、装甲型或侦查型，每种型号的初始属性和可改造项各不相同。玩家需根据舰队整体需求决定改造方向，例如若舰队缺乏前排承伤单位，可优先选择装甲型子型号并强化其生存能力；若需要快速侦查或骚扰，则侦查型的机动性改造更为关键。子型号的改造往往需要消耗额外技术值，因此需谨慎评估性价比。
实战中还需注意舰船编队的协同改造。单一舰船的强化虽能提升个体战力，但舰队配合才是胜负关键。若主力输出为范围伤害型舰船，则前排防御舰需强化减命中属性以拖延时间；若依赖舰载机作战，则需为航母配备防空强化模块。改造后的舰船需通过实战测试调整细节，例如对抗高护甲敌人时需补充穿透属性，而面对高速目标时则需优化命中率。
不同星系协议或敌对玩家的战术变化可能要求重新分配技术值，例如在资源争夺战中优先强化工程舰的采集效率，而在联盟战争中则侧重火力与生存平衡。建议保留部分技术值作为应急储备，并定期复盘战斗记录以优化改造方案。通过持续迭代，玩家可以逐步打造出适应多场景的顶级舰队。
